北京协和医学院由美国洛克菲勒基金会于1917年创办，是我国最早设有八年制临床医学专业和护理本科教育的重点医科大学。2007年5月18日，中国协和医科大学正式更名为北京协和医学院。党中央、国务院和国家历届领导人对院校的发展十分关心支持。江泽民主席1997年亲笔为院校题写了“严谨、博精、创新、奉献”的院校训;胡锦涛主席对院校发展寄予了深切关注和殷切期望。

协和医大是我国最早进行大学本科护理教育的地方，自1921年创办高级护理系至1952年停办期间培养了一大批高级护理人才，她们都先后成为我国护理界的领导和中坚力量。1985年学校又成立了护理系，恢复大学本科护理教育。1995年10月经卫生部批准，我校建立了全国首家护理学院，并设立护理硕士学位学科点，招收护理硕士学位研究生，旨在培养高层次护理人才，与世界护理教育接轨。现学校的护理教育门类齐全，包括研究生教育，大学本科、专科教育，成人在职脱产和不脱产的本、专科教育等。经卫生部同意，国家教育部批准北京协和医学院研究生院，在国外基金的资助下，我校对护理学专业教育进行了教学改革，将本科教育修业年限由原来的5年改为4年，并增设了3年制专科教育项目，改革了护理教育的课程模式，扩大了招生规模，旨在为国家培养更多高层次、高质量、适合医学科学发展的护理人才。

学校研究生教育始于1954年，中止于文革时期。1978年学校恢复研究生教育，自1981年国家实行学位制度以来，学校研究生教育有了较快的发展。经国务院批准，学校于1986年试办研究生院，1996年正式成立研究生院，是全国首批具有博士学位和硕士学位授予权的单位。经国务院学位委员会批准，自1993年开始学校可自行审批硕士学位授予学科专业点，1994年开始可自行审批博士生导师。现有博士学位授权学科专业点32个，硕士学位授权学科专业点44个。研究生的培养方式分为以实验室科学研究能力训练为主的科学学位和以临床实际工作能力训练为主的专业学位两类，可分别授予医学博士、理学博士(哲学博士)、工学博士、医学硕士、理学硕士、工学硕士、管理学硕士等学位。

院校拥有6所直属医院(北京协和医院、阜外心血管病医院、肿瘤医院、整形外科医院、血液病医院和皮肤病医院)和一所共建医院(北京天坛医院)，病床近5188张，集综合性医院和专科医院于一体，在心血管疾并恶性肿瘤、血液并疑难皮肤并 遗传性疾并器官再造、自身免疫性疾并内分泌疾病等重大疑难疾病的诊治方面达到国内领先和国际先进水平，形成了国内外闻名的医疗、教学和科研紧密结合的医疗服务体系。众多著名医学专家是院校高超医疗水平的集中体现，他们是国家医疗保健委员会、国家医学考试委员会、国家医疗事故鉴定专家委员会、中华医学会的核心力量，也是我国医疗新技术、新标准的倡导者和开拓者。

院校科研实力雄厚，医学科研包括基础医学、临床医学、预防医学、药物以及与医药学有关的生物、物理、化学等相关学科，覆盖了医学科学各领域。拥有6个国家级重点实验室、10个部门开放实验室、2个国家级工业试验基地、17个国家级中心、6个博士后科研流动站以及11个世界卫生组织合作中心。“十一五”期间，承担各类科研项目共计6367项，累计获科研项目资助额达22.1亿北京协和医学院研究生院，其中国家级科研项目资助金额占61%;累计获各类科技奖励成果199项，其中国家科学技术奖24项;累计获准专利215项，新药证书7项，位居全国医学院校之首。 此外，学校积极组织有关专家和人员参与艾滋病、病毒性肝炎等重大传染病重大专项工作。

根据教育部、卫生部共建协议《中国协和医科大学和清华大学关于落实两部协议的实施意见》，教育部《关于中国协和医科大学更名的通知》以及《国家事业单位登记管理局事业单位登记管理暂行条例实施细则》，中国协和医科大学正式更名为“北京协和医学院”;鉴于我校与清华大学紧密合作办学的需要，有时使用“北京协和医学院—”的名称。更名后，我校仍为独立法人单位，原隶属关系、人员编制、资产关系和经费管理体制保持不变。