1、这三者直接、最显而易见的区别，就是学费的区别。翻开招生计划本，一般情况下（特殊院校、专业除外）： 公办本科院校学费在4000-6000元/年之间； 民办本科院校学费在16000-20000元/年之间； 独立学院学费在16000-18000元/年之间。

2、办学主体 独立学院的举办方是普通高校与社会合作办学， 因此独立学院一般是设在某个大学的名下。 民办院校则有自己的校名，自己组织机构，自己的师资，自己的校园，自己独立颁发毕业证书。

3、办学层次 独立学院是指实施本科以上学历教育的普通高等学校与国家机构以外的社会组织或者个人合伙创立，因此独立学院一定是本科，而民办高校中专本科都有。

4、学历证书 独立学院和民办院校的的毕业生都可以获得获国家承认的学历证书，毕业证书可以在中国高等教育学生信息网上查询。 但独立学院毕业证书上加盖的是某某大学某某学院印章，而学校本部学生的毕业证书只盖有学校校名印章。例如厦门大学嘉庚学院的毕业证书加印的是“厦门大学嘉庚学院”的印章，区别于本部的“厦门大学”印章。 民办院校的毕业证加印的就是学校校名的印章。