国家重点学科（2个）
一级学科： 　　
　　船舶与海洋工程(下设三个二级学科：船舶与海洋结构物设计制造、水声工程、轮机工程)
二级学科： 　　
　　导航、制导与控制
“十一五”国防特色紧缺学科（3个）
核能科学与工程、核技术及应用、隐身技术与工程
国防科工委“十五”重点学科（７个）
固体力学、导航、制导与控制、船舶与海洋结构物设计制造、轮机工程、水声工程、核能科学与工程、辐射防护与环境保护
“十一五”国防特色主干学科（3个） 　　
轮机工程、导航、制导与控制、通信与信息系统 　　
“十一五”国防特色骨干学科（2个）
船舶与海洋结构物设计制造、固体力学
“十一五”国防特色支撑性基础学科（1个）
水声工程
“十一五”国防特色新兴交叉边缘学科（2个）
　　船舶电磁兼容、熔体化学与物理
“十一五”期间黑龙江省重点学科（28个）
学科群（4个） 　　
　　水声工程、海洋空间运载器系统技术声学、自动化科学、船舶动力工程
一级学科（5个）
力学、机械工程、信息与通信工程、控制科学与工程、船舶与海洋工程
重点交叉学科（2个）
光学工程、生物医学工程
二级学科（17个） 　　 　　
声学、航空宇航推进理论与工程、计算机软件与理论、检测技术与自动化装置、电力电子与电力工程、模式识别与智能系统、动力机械及工程、材料学、应用化学、信号与信息处理、核能科学与工程、产业经济学、思想政治教育、精密仪器及机械、计算机应用技术、管理科学与工程、热能工程