科技部负责惠民计划的总体协调；会同财政部研究制定惠民计划及其经费管理办法，组织计划实施，监督管理，绩效评价等；负责编制惠民计划先进科技成果目录指南（简称科技成果目录指南）、项目实施方案的咨询论证、立项批复、成果管理等。