南京农业大学的前身可以追溯到1902年三江师范学堂农业自然史系和1914年金陵大学农学本科。1952年全国高等学校院系相继成立。南京农学院由金陵大学农学院、中央大学农学院和浙江大学农学院部分院系合并组建。 1963年被确定为全国两所重点农业大学之一。 1972年，学校迁至扬州，与江苏农学院合并组建江苏农学院。 1979年迁回南京，恢复南京农学院。 1984年更名为南京农业大学。2000年由农业部划归教育部。
学校设有农学院、工学院、植物保护学院、资源与环境学院、园艺学院、动物科学与技术学院、无锡水产学院、兽医学院、食品科学与技术学院、经济与管理学院、公共管理学院（含土地管理学院）、人文与社会科学学院、生命科学学院、理学院、信息科学与技术学院、外国语学院、农村发展学院、金融学院、草原产业学院、国际教育学院、思想政治理论课教研室（部）。 有61个本科专业，33个硕士授权一级学科，12个专业学位授予权，16个博士授权一级学科，13个博士后流动站。 现有各类在校生32000余人，其中全日制本科生17000余人，硕士研究生8500余人。 现有教职工2700余人，其中：博士生导师340人，中国工程院院士2人南京农业大学录取分数线，国家和部级有突出贡献的中青年专家39人，“长江学者”、“千人计划”10人计划”专家南京农业大学录取分数线，教育部创新团队3人，国家级教学名师2人，13人获得国家杰出青年科学基金，100余人入选其他各类国家人才工程和人才计划。
学校人才培养涵盖本科教育、研究生教育、留学生教育、继续教育、干部培训等。 国家生命科学与技术人才培养基地和植物生产与动物科学国家级实验教学中心是首批通过全国高校本科教学工作优秀评估的高校之一。 2000年经教育部批准设立研究生院。
学校拥有作物学、农业资源利用、植物保护与兽医学4个国家一级重点学科，蔬菜学、农业经济管理与土地资源管理等3个国家二级重点学科，食品科学国家重点培育学科。学科方面，8个学科进入江苏大学优势学科建设项目，农学、植物与动物学、环境生态学、生物学、生物化学4个学科进入ESI学科世界前1%。
学校建有作物遗传与种质创新国家重点实验室、国家肉类质量与安全控制工程技术研究中心、国家信息化农业工程技术中心、国家大豆改良中心、农业部综合实验室、农村土地资源利用与改良。 拥有国家地方联合工程研究中心、绿色农药创制与应用技术国家地方联合工程研究中心等国家部省级科研平台62个。 “十一五”以来，学校科研经费达25亿元，获国家、部、省科技成果奖100余项，其中，作为第一完成单位，获国家科技进步一等奖1项，二等奖7项，技术发明二等奖2项。 学校依托雄厚的科研实力，积极服务社会，服务“三农”，创造了巨大的经济效益和社会效益，多次被评为科教兴农工作先进单位.
学校国际交流日趋活跃，国际化程度不断提高。 与30多个国家和地区的150多所大学和研究机构建立了联合培养学生、学术交流和科研合作关系。 先后开展了中美“1+2+1”本科项目、中澳“2+2双学位”本科项目、“硕士双学位”等中外合作办学项目。 "在中国和法国和英国。 拥有“中美食品安全与质量联合研究中心”、“南京农业大学-康奈尔大学国际技术转移中心”、“猪链球菌疾病诊断国际参考实验室”等多个国际合作平台。 2007年成为教育部“接受中国政府来华留学生奖学金名额”。 2008年成为全国首批“助学基地”之一。 2012年获批建设全球首家农业特色孔子学院。 2013年，学校发起并成功举办了首届“世界农业奖”评选颁奖活动。
学校校园总面积9平方公里，建筑面积72万平方米，资产总值29亿元。 馆藏图书资料206万余册（部），外文期刊1万余种，中文电子图书100万余册。 学校教学、科研、生活设施齐全，校园环境优美。
在百余年的办学历程中，学校秉承以“至诚、朴实、勤奋”为核心的南农精神，始终坚持“育人为本、立德树人”的办学理念。育人为先，弘扬学术，服务社会”。 优秀人才20万余人，其中院士51人。
展望未来，作为中国现代高等农业教育的先行者，南京农业大学将以人才为本，以学科建设为主线，以教育质量为生命，以科技创新为动力，以服务社会为己任。以文化传承为己任。 向世界一流农业大学目标迈进！
