两所学校各自的类型不同，没有好与不好。山西大同大学是一所综合类的大学，而长治医学院是一所医药类的高等学校。最主要的就是看你想学什么专业了。
山西大同大学山西大同大学坐落于历史文化名城——大同，实行两校区办学，御东校区位于大同市御东新区风景秀丽的文瀛湖畔，新平旺校区位于大同市矿区平泉路。
学校占地面积2121亩，建筑面积90.7万平方米。教学科研设备总值2.8亿元，图书馆藏书215万册。山西大同大学是一所省属全日制多科性大学，“卓越医生教育培养计划”试点高校，2006年3月经教育部批准，由原雁北师范学院、大同医学专科学校、大同高等专科学校、山西工业职业技术学院合并组建而成。办学历史可以追溯到20世纪50年代。
长治医学院长治医学院座落在素有红色之都、魅力之城美誉的山西省长治市，位于长治市解放东街161号，是一所省属全日制普通高等医学院校。学院创建于1946年，其前身是晋冀鲁豫白求恩国际和平医院总院开办的护士学校。
学校固定资产3.03亿元，占地面积777.80亩，建筑面积27.81万平方米。图书馆藏书70万册，中外期刊1200种，电子图书41万册。学院注重对学生动手能力的培养，不断加强实践教学基地建设，拥有附属和平医院、附属和济医院两所三级甲等直属附属医院和晋城市人民医院、临汾市地区医院、临汾市铁路医院、运城市中心医院等4所非直属附属医院；此外，学院还先后建立了37所教学实习医院、18个药学专业实践教学基地和11个思想政治理论课实践教学基地。
如果想学医学类专业长治医学院要比大同大学强，综合类的专业大同大学更胜一筹。
