窦房结系心脏自动节律性最高的起搏点。位于右心房上部，靠近右心房与上腔静脉交界处终沟的心外膜下，呈马蹄状，全长约15mm，宽约5mm，厚约2mm。窦房结中含有许多具有自动节律性的细胞，称为起搏细胞。

窦房结又称窦结，正常时是心脏的起搏点。窦房结位于上腔静脉和右心房交界处的界沟上端。结的长轴与界沟平行，其前上方的“头”位置稍高，可达界沟与右心耳嵴相连处，后下方的“尾”位置略低。窦房结的位置有个体差异。有的可骑跨至右心耳嵴连接处的左侧，有的则更偏右下方。窦房结位于心外膜下1mm的心房壁内，表面无心肌覆盖。窦房结的深面(除“尾”的尖端一小区接触心内膜组织外)一般不邻接心内膜，与心内膜之间常隔以右心房的心肌。窦房结表面常可见到神经纤维和神经末梢。

窦房结的形态大多呈两端尖、中间粗的梭形或半月形，有的被描述成形如带壳的蜗牛。但其形态多变，或粗短，或细长，或呈分叉形，或中间变窄。结的边缘不整齐，由结缘向外周发出指状突起。

窦房结的大小，长为10～15mm，最宽处3～5mm，最厚处为1～2mm，呈扁平状，结的长约为宽的2～3倍。窦房结下缘较厚，在横切面上，呈三角形，尖向上。

窦房结中心有一条较粗的窦房结动脉，围绕该动脉周围的细小的肌纤维构成窦房结的主体。这些细小的肌纤维聚集成簇，散在于致密胶原纤维编织成的网状结构的支架中。

结构特点由围绕在窦房结动脉周围细小肌纤维的主体构成。这些细小的肌纤维聚集成葡萄状，散在于致密胶原纤维编织成的网状结构的支架中。窦房结内有P细胞、移行细胞或称过渡细胞、普通心肌细胞和浦肯野细胞等4种细胞。结内尚有交感和副交感神经纤维分布。窦房结内的各型细胞，多数具有浦肯野纤维的特征。较小的窦房结细胞互相交织，并且可与某些大型的浦肯野细胞相延续。大部分浦肯野细胞和较小的结细胞构成离开窦房结的纤维束，进入心房参与结间束的组成。结细胞主要位于结的中央部色，苍白，因其具有起搏作用，是起搏细胞，又称P细胞。生理学表明，结细胞是起搏冲动的发生部位。结细胞外周的移行细胞，连接于结细胞与一般心肌细胞之间。现认为移行细胞是窦房结内的传导细胞。正常时，窦房结在心脏组织中自律性最高。因此，心跳的节律受窦房结控制，由窦房结发出的冲动所形成的心脏搏动，称为窦性心律。心肌细胞具有传导性，窦房结的传导性较慢，从而有其特殊的自我保护的特点。即能使结细胞产生的电脉冲易于从结细胞簇外传，但阻止其他刺激信号进入结细胞群，从而可使窦房结的功能不易被外来的信号所干扰，以保持其自律性的稳定。由于窦房结动脉不成比例地粗大，并穿经窦房结中央，窦房结发放冲动的频率，可能受窦房结动脉搏动刺激的调节。每次心脏收缩，血液进入冠状动脉的同时，窦房结动脉的口径和管径内血流速度，亦有时有相应地改变，牵拉结内的胶原纤维网，刺激网眼内的结细胞群，以影响和调节结细胞的放电频率。