目前全国共有42所高校进行自主招生
2003年就已经开始自主招生的有22所高校

北京大学 中国人民大学 清华大学 北京师范大学
中国政法大学 复旦大学 同济大学 上海交通大学
华东理工大学 华东师范大学 南京大学 东南大学
南京航空航天大学 南京理工大学 河海大学 中国药科大学
南京农业大学 浙江大学 重庆大学 中山大学
中国科学技术大学 华中科技大学
2004年增加了6所自主招生高校
西安交通大学 大连理工大学 东北大学 武汉大学
华中师范大学 华南理工大学
2005年新增了14所自主招生高校
北京邮电大学 北京交通大学 北京林业大学 北京科技大学
天津大学 南开大学 山东大学 厦门大学
东北师范大学 湖南大学 中南大学 四川大学
西安电子科技大学 电子科技大学
2006年新增增加11所自主招生高校 江南大学 北京化工大学 上海财经大学 中南财经政法大学
西北农林科技大学 武汉理工大学 中国地质大学(武汉 西南交通大学
中国矿业大学 中国海洋大学 北京中医药大学